Im Januar 2006 wurde die International Security Assistance Force (ISAF) nach Afghanistan entsandt, um das US-amerikanische und britische Militär im Kampf gegen die islamistischen paramilitärischen Taliban zu unterstützen. Die US-Regierung warf den Taliban vor, den Chef von al-Qaida, Osama bin Laden, beherbergt zu haben, und forderte seine Auslieferung. Die Taliban-Führung weigerte sich, dieser Forderung nachzukommen, und sagte, die Vereinigten Staaten hätten keine Beweise für Osamas Schuld bei den Anschlägen vom 11. September 2001 vorgelegt.
Ende 2001 war die militärische Struktur der Taliban praktisch zerstört und der Widerstand ihrer Unterstützer nahm die Form einer Guerillabewegung an. Westliche Länder haben viel in die Entwicklung der Demokratie und der sozialen Struktur Afghanistans investiert. 2004 gewann Hamid Karzai die erste Präsidentschaftswahl des Landes, ein Politiker, der dem Westen gegenüber loyal ist. Der Widerstand der Taliban-Anhänger konnte jedoch nicht unterdrückt werden. Die Guerilla kämpfte trotz der überwältigenden militärischen Überlegenheit der ISAF erbittert.
Frankreich erlitt wie andere Mitglieder des Bündnisses Verluste an Ausrüstung und Arbeitskräften. Während des zehnjährigen Krieges in Afghanistan wurden 83 Soldaten getötet und mehrere Male mehr verwundet. Die Entscheidung, Frankreich in die Militäroperation einzubeziehen, fand in der Bevölkerung keinen großen Anklang, und Berichte über Verluste unter französischen Soldaten verstärkten die Unzufriedenheit mit der Regierung.
Am 20. Januar 2012 erschoss in der Provinz Kapisa ein Mann in afghanischer Armeeuniform 4 und verwundete 16 französische Soldaten. Danach sagte Nicolas Sarkozy (französischer Präsident von 2007 bis 2012), dass Frankreich seine Militärpräsenz in diesem Land aussetzt, da die afghanische Regierung die Sicherheit der französischen Truppen nicht garantieren kann. Sarkozy versprach, bis Anfang 2014 Truppen aus Afghanistan abzuziehen.
2012 wurde François Hollande zum französischen Präsidenten gewählt, der einen neuen Plan zum Rückzug aus Afghanistan ankündigte. 2.000 Soldaten werden bis Ende 2012 abgezogen, 1.400 bleiben als Ausbilder und zur Bewachung sozialer Einrichtungen. Der Präsident begründete seine Entscheidung damit, dass die Gefahr durch Terroristen nachgelassen habe, die Demokratie stärker geworden sei und sich das Land eigenständig entwickeln müsse. Das Republikoberhaupt versprach, dass Frankreich Afghanistan weiterhin unterstützen werde, allerdings in anderer Form.
