Der dritte Film, Men in Black, ist eine Fortsetzung der berühmten amerikanischen Komödie. Mit Tommy Lee Jones und Will Smith in den Hauptrollen. Die Regie übernahm erneut Barry Sonnenfeld, Executive Producer hinter Steven Spielberg. Der Film startete in den Kinos am 23.05.2012.
Die Rolle des negativen Helden übernimmt diesmal Jemaine Clement, er spielt Boris. Dies ist der Schwerverbrecher, der aus dem Mondgefängnis entkommen ist. Er brennt vor Hass auf Agent Kay, der im Juli 1969 den Täter schnappte und ihn ohne Arm zurückließ. Als Kay plötzlich erfährt, dass Boris geflohen ist, bedauert er sehr, dass er ihn dann bei seiner Festnahme nicht getötet hat. Danach verschwindet der Agent einfach und nur sein Partner Jay erinnert sich an seine Existenz. Der Rest des Personals in Schwarz glaubt, dass Kay 1969 bei einer Konfrontation mit einem Kriminellen gestorben ist.
Die einzige Erklärung für eine solche Umkehrung der Realität ist eine Veränderung in der Vergangenheit. Jay und Agent O entscheiden, dass Boris involviert ist. Dies wird durch ein weiteres Ereignis kosmischen Ausmaßes bestätigt - die Invasion der Erde durch die Boris-Rasse. In der früheren Realität war dies unmöglich, da Kay auf dem Planeten ein Schutzgerät namens "ArkNet" installierte. Im Zusammenhang mit dem Tod des Agenten vor einigen Jahrzehnten hatte die Erde keine Barriere gegen Weltraumfeinde.
Jay entdeckt, dass Boris von Jeffrey Price, einem Elektronikhändler, der einen illegalen Zeitschieber in seinem Arsenal hatte, in die Vergangenheit geschickt wurde. Der Agent hat keine andere Wahl, als in die Vergangenheit zu reisen, um seinen Partner zu retten. Und er wird sofort von dem jungen Kay festgenommen. Während des Verhörs erzählt Jay ihm alles und der zukünftige Partner glaubt. Gemeinsam finden sie den Arkanian Griffin, der das ArkNet besitzt. Nun setzen die drei ihre Reise fort und machen sich auf den Weg, um Schutz auf dem Mond zu installieren. Doch auf einer Rakete werden sie vom Oberst festgenommen. Jetzt wird er Jays Geheimhüter.
Von diesem Moment an entwickeln sich die Ereignisse rasant. Die Helden treffen auf zwei Boris und es kommt zum Kampf. Ein Verbrecher aus der Zukunft wird in den Raketenschacht geworfen, und der junge Boris wird ihm nachgeschickt. Schutz für die Erde wurde eingerichtet. Und jetzt, so scheint es, ist Jays Mission abgeschlossen, aber ein junger Krimineller, der auf wundersame Weise überlebt, taucht auf. Der Oberst stirbt, aber auch Boris wird zerstört. Und jetzt taucht ein neuer Charakter im Film auf. Ein Junge steigt aus dem Wagen des Colonels und macht sich auf die Suche nach seinem Vater. Der Agent erkennt sich selbst. Jay kehrt in seine Zeit zurück und trifft Kay im Café. Alles ging zurück.
